Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF4P23510 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms