Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRDP23468 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
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