Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PparaP23204 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PparaP23204 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PparaP23204 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PparaP23204 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PparaP23204 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PparaP23204 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PparaP23204 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PparaP23204 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PparaP23204 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PparaP23204 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PparaP23204 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PparaP23204 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PparaP23204 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PparaP23204 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PparaP23204 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PparaP23204 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PparaP23204 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PparaP23204 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PparaP23204 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PparaP23204 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PparaP23204 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PparaP23204 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PparaP23204 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PparaP23204 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PparaP23204 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PparaP23204 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PparaP23204 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PparaP23204 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PparaP23204 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PparaP23204 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PparaP23204 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PparaP23204 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PparaP23204 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PparaP23204 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PparaP23204 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PparaP23204 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PparaP23204 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PparaP23204 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PparaP23204 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PparaP23204 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PparaP23204 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PparaP23204 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PparaP23204 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PparaP23204 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PparaP23204 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PparaP23204 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PparaP23204 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PparaP23204 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PparaP23204 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PparaP23204 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PparaP23204 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PparaP23204 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PparaP23204 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PparaP23204 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PparaP23204 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PparaP23204 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PparaP23204 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PparaP23204 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PparaP23204 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PparaP23204 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PparaP23204 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PparaP23204 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PparaP23204 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PparaP23204 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PparaP23204 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PparaP23204 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PparaP23204 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PparaP23204 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PparaP23204 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PparaP23204 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PparaP23204 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PparaP23204 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PparaP23204 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PparaP23204 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PparaP23204 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PparaP23204 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PparaP23204 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PparaP23204 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PparaP23204 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PparaP23204 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PparaP23204 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PparaP23204 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PparaP23204 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PparaP23204 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PparaP23204 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PparaP23204 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PparaP23204 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PparaP23204 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PparaP23204 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PparaP23204 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PparaP23204 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PparaP23204 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PparaP23204 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PparaP23204 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PparaP23204 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PparaP23204 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PparaP23204 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PparaP23204 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PparaP23204 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms