Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME2P22392 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME2P22392 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME2P22392 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NME2P22392 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME2P22392 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME2P22392 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME2P22392 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME2P22392 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME2P22392 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME2P22392 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME2P22392 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NME2P22392 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NME2P22392 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NME2P22392 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P22392 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P22392 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P22392 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P22392 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P22392 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P22392 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P22392 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P22392 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P22392 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P22392 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P22392 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P22392 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P22392 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P22392 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P22392 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P22392 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P22392 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P22392 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P22392 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P22392 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P22392 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P22392 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P22392 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P22392 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P22392 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME2P22392 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME2P22392 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME2P22392 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME2P22392 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NME2P22392 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NME2P22392 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P22392 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P22392 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P22392 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P22392 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P22392 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P22392 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P22392 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P22392 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P22392 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P22392 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P22392 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P22392 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P22392 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P22392 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P22392 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P22392 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P22392 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P22392 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P22392 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P22392 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P22392 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P22392 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P22392 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P22392 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P22392 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P22392 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P22392 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P22392 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P22392 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P22392 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P22392 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P22392 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P22392 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P22392 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P22392 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P22392 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P22392 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P22392 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P22392 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P22392 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P22392 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P22392 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P22392 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME2P22392 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME2P22392 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NME2P22392 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME2P22392 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME2P22392 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P22392 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P22392 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P22392 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P22392 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P22392 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P22392 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms