Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChrneP20782 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChrneP20782 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChrneP20782 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChrneP20782 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChrneP20782 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChrneP20782 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChrneP20782 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChrneP20782 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChrneP20782 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChrneP20782 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChrneP20782 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChrneP20782 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChrneP20782 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms