Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prim1P20664 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prim1P20664 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prim1P20664 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Prim1P20664 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prim1P20664 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Prim1P20664 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prim1P20664 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prim1P20664 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prim1P20664 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 361.3 ms