Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB3BP20337 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3BP20337 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms