Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cox4i1P19783 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cox4i1P19783 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cox4i1P19783 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms