Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC3P19447 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ERCC3P19447 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms