Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13aP19253 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl13aP19253 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl13aP19253 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13aP19253 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13aP19253 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13aP19253 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13aP19253 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13aP19253 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13aP19253 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms