Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tph1P17532 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tph1P17532 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tph1P17532 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tph1P17532 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tph1P17532 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tph1P17532 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tph1P17532 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tph1P17532 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tph1P17532 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph1P17532 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tph1P17532 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tph1P17532 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tph1P17532 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tph1P17532 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tph1P17532 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tph1P17532 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms