Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmga1P17095 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms