Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LdhbP16125 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LdhbP16125 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LdhbP16125 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LdhbP16125 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LdhbP16125 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LdhbP16125 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LdhbP16125 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LdhbP16125 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LdhbP16125 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LdhbP16125 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LdhbP16125 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LdhbP16125 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LdhbP16125 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LdhbP16125 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LdhbP16125 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LdhbP16125 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms