Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHN1P15882 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHN1P15882 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHN1P15882 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHN1P15882 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHN1P15882 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHN1P15882 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHN1P15882 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHN1P15882 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CHN1P15882 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHN1P15882 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHN1P15882 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHN1P15882 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHN1P15882 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHN1P15882 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHN1P15882 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHN1P15882 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHN1P15882 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHN1P15882 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHN1P15882 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHN1P15882 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHN1P15882 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHN1P15882 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHN1P15882 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHN1P15882 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHN1P15882 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHN1P15882 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHN1P15882 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHN1P15882 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN1P15882 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN1P15882 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN1P15882 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN1P15882 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN1P15882 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN1P15882 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN1P15882 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN1P15882 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN1P15882 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN1P15882 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHN1P15882 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHN1P15882 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHN1P15882 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHN1P15882 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHN1P15882 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHN1P15882 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHN1P15882 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHN1P15882 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHN1P15882 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHN1P15882 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHN1P15882 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHN1P15882 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHN1P15882 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHN1P15882 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHN1P15882 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHN1P15882 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHN1P15882 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHN1P15882 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHN1P15882 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHN1P15882 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHN1P15882 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHN1P15882 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHN1P15882 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHN1P15882 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHN1P15882 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHN1P15882 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHN1P15882 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHN1P15882 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHN1P15882 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHN1P15882 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHN1P15882 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHN1P15882 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHN1P15882 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHN1P15882 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHN1P15882 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHN1P15882 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHN1P15882 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHN1P15882 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHN1P15882 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHN1P15882 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHN1P15882 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN1P15882 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN1P15882 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN1P15882 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN1P15882 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN1P15882 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN1P15882 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHN1P15882 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHN1P15882 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHN1P15882 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHN1P15882 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHN1P15882 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHN1P15882 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHN1P15882 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CHN1P15882 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHN1P15882 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHN1P15882 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHN1P15882 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHN1P15882 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHN1P15882 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHN1P15882 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms