Protein–RNA interactions for Protein: P15863

PAX1, Paired box protein Pax-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX1P15863 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX1P15863 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX1P15863 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX1P15863 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX1P15863 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX1P15863 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX1P15863 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX1P15863 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX1P15863 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX1P15863 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX1P15863 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX1P15863 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX1P15863 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX1P15863 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAX1P15863 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAX1P15863 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAX1P15863 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX1P15863 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX1P15863 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX1P15863 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX1P15863 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX1P15863 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX1P15863 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX1P15863 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX1P15863 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX1P15863 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX1P15863 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX1P15863 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX1P15863 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX1P15863 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX1P15863 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX1P15863 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX1P15863 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX1P15863 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX1P15863 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX1P15863 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX1P15863 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX1P15863 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX1P15863 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX1P15863 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX1P15863 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX1P15863 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX1P15863 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX1P15863 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX1P15863 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX1P15863 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX1P15863 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX1P15863 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX1P15863 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX1P15863 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX1P15863 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX1P15863 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX1P15863 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX1P15863 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX1P15863 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX1P15863 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX1P15863 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX1P15863 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX1P15863 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX1P15863 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX1P15863 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX1P15863 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX1P15863 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX1P15863 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX1P15863 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX1P15863 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX1P15863 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX1P15863 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX1P15863 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX1P15863 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX1P15863 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX1P15863 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX1P15863 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX1P15863 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX1P15863 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX1P15863 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX1P15863 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX1P15863 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX1P15863 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX1P15863 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX1P15863 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX1P15863 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX1P15863 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX1P15863 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX1P15863 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX1P15863 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX1P15863 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX1P15863 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms