Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF44P15621 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF44P15621 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms