Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAV1P15498 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAV1P15498 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAV1P15498 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV1P15498 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV1P15498 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV1P15498 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV1P15498 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV1P15498 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV1P15498 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV1P15498 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV1P15498 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV1P15498 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV1P15498 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAV1P15498 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAV1P15498 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAV1P15498 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAV1P15498 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV1P15498 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV1P15498 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV1P15498 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV1P15498 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV1P15498 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV1P15498 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAV1P15498 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAV1P15498 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAV1P15498 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAV1P15498 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAV1P15498 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAV1P15498 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAV1P15498 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
VAV1P15498 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAV1P15498 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAV1P15498 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV1P15498 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV1P15498 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV1P15498 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV1P15498 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV1P15498 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV1P15498 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV1P15498 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAV1P15498 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAV1P15498 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VAV1P15498 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAV1P15498 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV1P15498 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV1P15498 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV1P15498 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV1P15498 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV1P15498 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV1P15498 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV1P15498 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV1P15498 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV1P15498 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV1P15498 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV1P15498 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV1P15498 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV1P15498 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV1P15498 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV1P15498 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV1P15498 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV1P15498 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV1P15498 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV1P15498 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV1P15498 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV1P15498 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV1P15498 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV1P15498 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV1P15498 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV1P15498 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV1P15498 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV1P15498 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV1P15498 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV1P15498 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV1P15498 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV1P15498 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV1P15498 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV1P15498 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV1P15498 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV1P15498 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV1P15498 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV1P15498 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV1P15498 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV1P15498 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV1P15498 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV1P15498 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV1P15498 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms