Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrgnP13609 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrgnP13609 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SrgnP13609 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrgnP13609 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SrgnP13609 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrgnP13609 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms