Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CETPP11597 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CETPP11597 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CETPP11597 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CETPP11597 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CETPP11597 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CETPP11597 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CETPP11597 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CETPP11597 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CETPP11597 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CETPP11597 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CETPP11597 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CETPP11597 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CETPP11597 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CETPP11597 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CETPP11597 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CETPP11597 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CETPP11597 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CETPP11597 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CETPP11597 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CETPP11597 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CETPP11597 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CETPP11597 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CETPP11597 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CETPP11597 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CETPP11597 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CETPP11597 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CETPP11597 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CETPP11597 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CETPP11597 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CETPP11597 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CETPP11597 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CETPP11597 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CETPP11597 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CETPP11597 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CETPP11597 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CETPP11597 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CETPP11597 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CETPP11597 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CETPP11597 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CETPP11597 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CETPP11597 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CETPP11597 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CETPP11597 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CETPP11597 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CETPP11597 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CETPP11597 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CETPP11597 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CETPP11597 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CETPP11597 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CETPP11597 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CETPP11597 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CETPP11597 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CETPP11597 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CETPP11597 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CETPP11597 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CETPP11597 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CETPP11597 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CETPP11597 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CETPP11597 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CETPP11597 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CETPP11597 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CETPP11597 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CETPP11597 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CETPP11597 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CETPP11597 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CETPP11597 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CETPP11597 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CETPP11597 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CETPP11597 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CETPP11597 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CETPP11597 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CETPP11597 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CETPP11597 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CETPP11597 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CETPP11597 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CETPP11597 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CETPP11597 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CETPP11597 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CETPP11597 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CETPP11597 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CETPP11597 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CETPP11597 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CETPP11597 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CETPP11597 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CETPP11597 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CETPP11597 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CETPP11597 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CETPP11597 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CETPP11597 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CETPP11597 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CETPP11597 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CETPP11597 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CETPP11597 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CETPP11597 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CETPP11597 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CETPP11597 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CETPP11597 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CETPP11597 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CETPP11597 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms