Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DMDP11532 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DMDP11532 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DMDP11532 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DMDP11532 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DMDP11532 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DMDP11532 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DMDP11532 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DMDP11532 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DMDP11532 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DMDP11532 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DMDP11532 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DMDP11532 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DMDP11532 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DMDP11532 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DMDP11532 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DMDP11532 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DMDP11532 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DMDP11532 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DMDP11532 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DMDP11532 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DMDP11532 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DMDP11532 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DMDP11532 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DMDP11532 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DMDP11532 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DMDP11532 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DMDP11532 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DMDP11532 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DMDP11532 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DMDP11532 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DMDP11532 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DMDP11532 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DMDP11532 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DMDP11532 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DMDP11532 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DMDP11532 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DMDP11532 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DMDP11532 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DMDP11532 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DMDP11532 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DMDP11532 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DMDP11532 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DMDP11532 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DMDP11532 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DMDP11532 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DMDP11532 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DMDP11532 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DMDP11532 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DMDP11532 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DMDP11532 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DMDP11532 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DMDP11532 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DMDP11532 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DMDP11532 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DMDP11532 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DMDP11532 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DMDP11532 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DMDP11532 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DMDP11532 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DMDP11532 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DMDP11532 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DMDP11532 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DMDP11532 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DMDP11532 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DMDP11532 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DMDP11532 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DMDP11532 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DMDP11532 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DMDP11532 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DMDP11532 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DMDP11532 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DMDP11532 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DMDP11532 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DMDP11532 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DMDP11532 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DMDP11532 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DMDP11532 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DMDP11532 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DMDP11532 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DMDP11532 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DMDP11532 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DMDP11532 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DMDP11532 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DMDP11532 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DMDP11532 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DMDP11532 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DMDP11532 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DMDP11532 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DMDP11532 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DMDP11532 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DMDP11532 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DMDP11532 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DMDP11532 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DMDP11532 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DMDP11532 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DMDP11532 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DMDP11532 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DMDP11532 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DMDP11532 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms