Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRM1P11229 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms