Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prf1P10820 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prf1P10820 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prf1P10820 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prf1P10820 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prf1P10820 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prf1P10820 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prf1P10820 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prf1P10820 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prf1P10820 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prf1P10820 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prf1P10820 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prf1P10820 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prf1P10820 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prf1P10820 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prf1P10820 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prf1P10820 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms