Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHGAP10645 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHGAP10645 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHGAP10645 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHGAP10645 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHGAP10645 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHGAP10645 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHGAP10645 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHGAP10645 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHGAP10645 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHGAP10645 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHGAP10645 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CHGAP10645 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHGAP10645 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHGAP10645 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHGAP10645 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CHGAP10645 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CHGAP10645 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CHGAP10645 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHGAP10645 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHGAP10645 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHGAP10645 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHGAP10645 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHGAP10645 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHGAP10645 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHGAP10645 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHGAP10645 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHGAP10645 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CHGAP10645 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CHGAP10645 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHGAP10645 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CHGAP10645 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHGAP10645 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHGAP10645 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHGAP10645 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CHGAP10645 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHGAP10645 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CHGAP10645 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CHGAP10645 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHGAP10645 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHGAP10645 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHGAP10645 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHGAP10645 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHGAP10645 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHGAP10645 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CHGAP10645 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHGAP10645 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHGAP10645 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHGAP10645 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHGAP10645 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHGAP10645 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHGAP10645 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHGAP10645 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHGAP10645 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHGAP10645 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHGAP10645 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHGAP10645 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHGAP10645 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHGAP10645 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHGAP10645 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CHGAP10645 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHGAP10645 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHGAP10645 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHGAP10645 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHGAP10645 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHGAP10645 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHGAP10645 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHGAP10645 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHGAP10645 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHGAP10645 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHGAP10645 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHGAP10645 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHGAP10645 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CHGAP10645 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHGAP10645 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHGAP10645 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHGAP10645 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CHGAP10645 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHGAP10645 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHGAP10645 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHGAP10645 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHGAP10645 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHGAP10645 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHGAP10645 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHGAP10645 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHGAP10645 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHGAP10645 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHGAP10645 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHGAP10645 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHGAP10645 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHGAP10645 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHGAP10645 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHGAP10645 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHGAP10645 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHGAP10645 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHGAP10645 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHGAP10645 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHGAP10645 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHGAP10645 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CHGAP10645 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms