Protein–RNA interactions for Protein: P0CW03

Ly6c2, Lymphocyte antigen 6C2, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c2P0CW03 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c2P0CW03 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ly6c2P0CW03 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c2P0CW03 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c2P0CW03 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c2P0CW03 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c2P0CW03 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c2P0CW03 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c2P0CW03 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c2P0CW03 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms