Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC172P0C7W6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC172P0C7W6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC172P0C7W6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms