Protein–RNA interactions for Protein: P0C090

Rc3h2, Roquin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rc3h2P0C090 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rc3h2P0C090 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rc3h2P0C090 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rc3h2P0C090 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rc3h2P0C090 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rc3h2P0C090 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rc3h2P0C090 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rc3h2P0C090 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms