Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPAP09012 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNRPAP09012 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPAP09012 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms