Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKHD1P08F94 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKHD1P08F94 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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