Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPP08247 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYPP08247 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPP08247 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPP08247 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPP08247 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPP08247 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPP08247 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPP08247 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYPP08247 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYPP08247 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYPP08247 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYPP08247 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYPP08247 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPP08247 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPP08247 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPP08247 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPP08247 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPP08247 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPP08247 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYPP08247 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPP08247 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPP08247 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPP08247 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPP08247 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPP08247 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYPP08247 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYPP08247 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYPP08247 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPP08247 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPP08247 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPP08247 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPP08247 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPP08247 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPP08247 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYPP08247 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPP08247 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPP08247 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPP08247 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPP08247 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPP08247 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPP08247 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPP08247 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPP08247 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPP08247 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYPP08247 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPP08247 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPP08247 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYPP08247 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPP08247 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPP08247 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPP08247 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPP08247 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYPP08247 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYPP08247 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYPP08247 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYPP08247 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYPP08247 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPP08247 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPP08247 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPP08247 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPP08247 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPP08247 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPP08247 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPP08247 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYPP08247 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPP08247 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPP08247 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPP08247 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYPP08247 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPP08247 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPP08247 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPP08247 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPP08247 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPP08247 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPP08247 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPP08247 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPP08247 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPP08247 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPP08247 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYPP08247 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPP08247 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPP08247 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPP08247 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPP08247 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPP08247 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPP08247 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPP08247 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPP08247 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYPP08247 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPP08247 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPP08247 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYPP08247 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYPP08247 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYPP08247 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYPP08247 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPP08247 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPP08247 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPP08247 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPP08247 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms