Protein–RNA interactions for Protein: P07310

Ckm, Creatine kinase M-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkmP07310 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkmP07310 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkmP07310 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CkmP07310 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkmP07310 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkmP07310 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkmP07310 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkmP07310 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CkmP07310 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CkmP07310 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CkmP07310 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CkmP07310 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CkmP07310 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CkmP07310 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CkmP07310 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CkmP07310 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CkmP07310 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkmP07310 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkmP07310 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkmP07310 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkmP07310 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkmP07310 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkmP07310 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkmP07310 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CkmP07310 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CkmP07310 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CkmP07310 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CkmP07310 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CkmP07310 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CkmP07310 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CkmP07310 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkmP07310 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CkmP07310 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkmP07310 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkmP07310 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkmP07310 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkmP07310 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkmP07310 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkmP07310 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkmP07310 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkmP07310 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkmP07310 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkmP07310 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkmP07310 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkmP07310 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkmP07310 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkmP07310 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkmP07310 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkmP07310 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkmP07310 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkmP07310 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkmP07310 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkmP07310 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CkmP07310 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CkmP07310 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CkmP07310 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CkmP07310 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CkmP07310 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CkmP07310 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CkmP07310 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkmP07310 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkmP07310 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkmP07310 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkmP07310 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkmP07310 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkmP07310 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkmP07310 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkmP07310 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkmP07310 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkmP07310 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkmP07310 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CkmP07310 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CkmP07310 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CkmP07310 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CkmP07310 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CkmP07310 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CkmP07310 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CkmP07310 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CkmP07310 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CkmP07310 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CkmP07310 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CkmP07310 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CkmP07310 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CkmP07310 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CkmP07310 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CkmP07310 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CkmP07310 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CkmP07310 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CkmP07310 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CkmP07310 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CkmP07310 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CkmP07310 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CkmP07310 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CkmP07310 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CkmP07310 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CkmP07310 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CkmP07310 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CkmP07310 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CkmP07310 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CkmP07310 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms