Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtrP07309 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtrP07309 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtrP07309 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtrP07309 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtrP07309 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtrP07309 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtrP07309 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtrP07309 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtrP07309 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms