Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APODP05090 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APODP05090 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APODP05090 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APODP05090 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APODP05090 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APODP05090 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APODP05090 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APODP05090 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APODP05090 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APODP05090 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APODP05090 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APODP05090 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APODP05090 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APODP05090 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APODP05090 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APODP05090 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APODP05090 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APODP05090 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APODP05090 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APODP05090 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APODP05090 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APODP05090 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APODP05090 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APODP05090 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APODP05090 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APODP05090 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APODP05090 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APODP05090 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APODP05090 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APODP05090 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APODP05090 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APODP05090 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APODP05090 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APODP05090 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APODP05090 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APODP05090 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APODP05090 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APODP05090 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
APODP05090 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APODP05090 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APODP05090 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APODP05090 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APODP05090 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APODP05090 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APODP05090 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APODP05090 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APODP05090 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APODP05090 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APODP05090 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APODP05090 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APODP05090 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APODP05090 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APODP05090 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APODP05090 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APODP05090 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APODP05090 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APODP05090 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APODP05090 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APODP05090 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APODP05090 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APODP05090 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APODP05090 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APODP05090 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APODP05090 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APODP05090 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APODP05090 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APODP05090 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APODP05090 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APODP05090 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APODP05090 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APODP05090 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APODP05090 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APODP05090 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APODP05090 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APODP05090 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APODP05090 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APODP05090 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APODP05090 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APODP05090 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APODP05090 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APODP05090 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APODP05090 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APODP05090 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APODP05090 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APODP05090 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APODP05090 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APODP05090 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APODP05090 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APODP05090 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APODP05090 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APODP05090 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APODP05090 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APODP05090 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APODP05090 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APODP05090 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APODP05090 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APODP05090 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APODP05090 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APODP05090 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms