Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01725 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01725 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01725 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01725 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01725 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01725 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01725 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01725 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01725 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01725 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01725 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01725 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01725 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01725 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01725 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01725 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01725 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01725 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01725 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01725 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01725 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01725 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01725 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01725 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01725 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01725 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01725 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01725 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01725 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01725 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01725 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01725 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01725 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01725 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01725 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01725 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01725 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01725 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01725 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01725 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01725 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01725 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01725 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01725 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01725 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01725 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01725 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01725 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01725 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01725 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01725 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01725 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01725 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01725 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01725 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01725 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01725 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01725 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01725 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01725 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01725 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01725 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01725 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01725 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01725 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01725 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01725 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01725 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01725 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01725 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01725 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01725 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01725 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01725 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01725 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01725 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01725 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01725 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P01725 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01725 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01725 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01725 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01725 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01725 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01725 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01725 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01725 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01725 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms