Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01678 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01678 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
P01678 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01678 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01678 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01678 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01678 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01678 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01678 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01678 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01678 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01678 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01678 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01678 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01678 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01678 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01678 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01678 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01678 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01678 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01678 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01678 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01678 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01678 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01678 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01678 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01678 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01678 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01678 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01678 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01678 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01678 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01678 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01678 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
P01678 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01678 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01678 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01678 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01678 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01678 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01678 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01678 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01678 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01678 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01678 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01678 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01678 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01678 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
P01678 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01678 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01678 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01678 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01678 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
P01678 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01678 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01678 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01678 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01678 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01678 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01678 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01678 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
P01678 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
P01678 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
P01678 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21■□□□□ 0.95
P01678 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P01678 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
P01678 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01678 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01678 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01678 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01678 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
P01678 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P01678 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
P01678 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01678 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01678 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01678 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01678 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01678 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01678 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01678 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01678 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01678 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01678 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01678 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01678 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01678 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms