Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01647 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01647 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01647 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01647 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01647 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01647 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01647 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
P01647 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P01647 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
P01647 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P01647 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01647 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01647 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01647 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01647 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01647 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01647 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01647 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
P01647 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01647 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
P01647 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01647 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01647 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01647 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01647 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01647 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
P01647 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01647 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01647 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01647 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01647 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01647 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01647 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01647 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01647 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01647 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01647 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01647 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01647 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01647 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01647 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01647 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01647 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01647 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01647 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
P01647 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01647 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01647 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01647 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01647 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
P01647 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01647 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01647 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
P01647 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
P01647 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01647 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01647 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01647 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01647 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01647 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
P01647 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01647 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01647 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01647 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01647 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01647 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01647 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01647 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01647 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01647 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01647 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01647 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01647 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01647 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
P01647 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01647 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01647 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01647 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01647 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01647 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01647 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
P01647 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01647 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
P01647 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01647 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01647 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01647 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01647 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01647 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01647 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01647 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01647 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01647 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01647 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
P01647 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01647 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01647 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01647 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
P01647 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms