Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOL3O95236 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOL3O95236 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOL3O95236 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOL3O95236 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOL3O95236 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOL3O95236 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOL3O95236 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOL3O95236 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOL3O95236 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOL3O95236 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOL3O95236 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOL3O95236 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOL3O95236 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOL3O95236 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOL3O95236 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOL3O95236 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOL3O95236 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOL3O95236 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOL3O95236 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOL3O95236 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOL3O95236 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOL3O95236 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOL3O95236 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOL3O95236 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOL3O95236 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOL3O95236 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOL3O95236 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOL3O95236 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOL3O95236 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOL3O95236 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOL3O95236 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOL3O95236 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOL3O95236 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOL3O95236 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL3O95236 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL3O95236 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL3O95236 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL3O95236 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL3O95236 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL3O95236 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL3O95236 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL3O95236 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL3O95236 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL3O95236 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL3O95236 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL3O95236 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL3O95236 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL3O95236 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL3O95236 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL3O95236 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL3O95236 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL3O95236 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL3O95236 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL3O95236 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL3O95236 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL3O95236 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL3O95236 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL3O95236 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL3O95236 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL3O95236 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL3O95236 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL3O95236 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL3O95236 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL3O95236 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL3O95236 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL3O95236 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL3O95236 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL3O95236 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL3O95236 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL3O95236 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL3O95236 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL3O95236 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL3O95236 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOL3O95236 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL3O95236 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL3O95236 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL3O95236 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL3O95236 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL3O95236 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL3O95236 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL3O95236 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL3O95236 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL3O95236 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL3O95236 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL3O95236 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL3O95236 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL3O95236 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL3O95236 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL3O95236 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL3O95236 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL3O95236 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL3O95236 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL3O95236 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL3O95236 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL3O95236 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL3O95236 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL3O95236 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL3O95236 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL3O95236 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms