Protein–RNA interactions for Protein: O95199

RCBTB2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB2O95199 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCBTB2O95199 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCBTB2O95199 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCBTB2O95199 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCBTB2O95199 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCBTB2O95199 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RCBTB2O95199 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCBTB2O95199 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCBTB2O95199 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCBTB2O95199 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCBTB2O95199 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCBTB2O95199 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCBTB2O95199 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCBTB2O95199 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms