Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3DO95025 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3DO95025 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3DO95025 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms