Protein–RNA interactions for Protein: O94993

SOX30, Transcription factor SOX-30, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX30O94993 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX30O94993 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX30O94993 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX30O94993 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX30O94993 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX30O94993 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX30O94993 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX30O94993 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX30O94993 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX30O94993 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX30O94993 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX30O94993 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX30O94993 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX30O94993 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX30O94993 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX30O94993 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX30O94993 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX30O94993 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX30O94993 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX30O94993 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX30O94993 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX30O94993 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX30O94993 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX30O94993 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX30O94993 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX30O94993 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX30O94993 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX30O94993 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX30O94993 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX30O94993 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX30O94993 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX30O94993 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX30O94993 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX30O94993 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX30O94993 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX30O94993 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX30O94993 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX30O94993 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX30O94993 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX30O94993 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX30O94993 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX30O94993 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX30O94993 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX30O94993 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX30O94993 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX30O94993 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX30O94993 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX30O94993 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX30O94993 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX30O94993 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX30O94993 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX30O94993 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX30O94993 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX30O94993 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX30O94993 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX30O94993 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX30O94993 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX30O94993 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX30O94993 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX30O94993 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX30O94993 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX30O94993 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX30O94993 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX30O94993 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX30O94993 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX30O94993 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX30O94993 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX30O94993 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX30O94993 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX30O94993 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX30O94993 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX30O94993 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX30O94993 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX30O94993 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX30O94993 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX30O94993 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX30O94993 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX30O94993 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX30O94993 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX30O94993 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX30O94993 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX30O94993 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX30O94993 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX30O94993 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX30O94993 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX30O94993 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX30O94993 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX30O94993 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX30O94993 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms