Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN7O94888 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN7O94888 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN7O94888 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms