Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tnnt1O88346 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnnt1O88346 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnnt1O88346 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms