Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOO75962 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOO75962 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOO75962 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOO75962 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOO75962 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOO75962 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOO75962 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIOO75962 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIOO75962 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIOO75962 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIOO75962 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIOO75962 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIOO75962 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIOO75962 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIOO75962 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIOO75962 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIOO75962 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIOO75962 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOO75962 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOO75962 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOO75962 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIOO75962 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIOO75962 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIOO75962 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIOO75962 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIOO75962 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOO75962 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOO75962 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOO75962 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOO75962 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOO75962 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOO75962 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOO75962 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOO75962 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOO75962 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOO75962 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIOO75962 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIOO75962 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIOO75962 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIOO75962 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIOO75962 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIOO75962 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIOO75962 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIOO75962 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOO75962 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOO75962 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOO75962 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOO75962 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOO75962 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOO75962 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOO75962 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIOO75962 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIOO75962 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIOO75962 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIOO75962 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIOO75962 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIOO75962 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIOO75962 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIOO75962 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIOO75962 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIOO75962 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIOO75962 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIOO75962 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIOO75962 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOO75962 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOO75962 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOO75962 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOO75962 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOO75962 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOO75962 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOO75962 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOO75962 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOO75962 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOO75962 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOO75962 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOO75962 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOO75962 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOO75962 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIOO75962 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIOO75962 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOO75962 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOO75962 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOO75962 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOO75962 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOO75962 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOO75962 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOO75962 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOO75962 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOO75962 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOO75962 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOO75962 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOO75962 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIOO75962 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIOO75962 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOO75962 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOO75962 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIOO75962 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIOO75962 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIOO75962 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms