Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BANF1O75531 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BANF1O75531 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BANF1O75531 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BANF1O75531 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BANF1O75531 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BANF1O75531 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BANF1O75531 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BANF1O75531 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BANF1O75531 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BANF1O75531 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BANF1O75531 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BANF1O75531 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BANF1O75531 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BANF1O75531 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BANF1O75531 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BANF1O75531 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BANF1O75531 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BANF1O75531 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BANF1O75531 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BANF1O75531 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BANF1O75531 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BANF1O75531 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BANF1O75531 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BANF1O75531 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BANF1O75531 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BANF1O75531 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BANF1O75531 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BANF1O75531 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BANF1O75531 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BANF1O75531 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BANF1O75531 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BANF1O75531 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BANF1O75531 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BANF1O75531 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BANF1O75531 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BANF1O75531 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BANF1O75531 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BANF1O75531 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BANF1O75531 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BANF1O75531 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BANF1O75531 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BANF1O75531 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BANF1O75531 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BANF1O75531 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BANF1O75531 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BANF1O75531 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BANF1O75531 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BANF1O75531 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BANF1O75531 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BANF1O75531 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BANF1O75531 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BANF1O75531 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BANF1O75531 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BANF1O75531 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BANF1O75531 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BANF1O75531 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BANF1O75531 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BANF1O75531 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BANF1O75531 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BANF1O75531 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BANF1O75531 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BANF1O75531 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BANF1O75531 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BANF1O75531 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BANF1O75531 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BANF1O75531 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BANF1O75531 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BANF1O75531 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BANF1O75531 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BANF1O75531 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BANF1O75531 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BANF1O75531 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BANF1O75531 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BANF1O75531 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BANF1O75531 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BANF1O75531 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BANF1O75531 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BANF1O75531 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BANF1O75531 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BANF1O75531 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BANF1O75531 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BANF1O75531 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BANF1O75531 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BANF1O75531 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BANF1O75531 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BANF1O75531 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BANF1O75531 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BANF1O75531 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BANF1O75531 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BANF1O75531 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BANF1O75531 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BANF1O75531 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BANF1O75531 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BANF1O75531 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BANF1O75531 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BANF1O75531 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BANF1O75531 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BANF1O75531 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BANF1O75531 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms