Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSO75390 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSO75390 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSO75390 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSO75390 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSO75390 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSO75390 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSO75390 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSO75390 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSO75390 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSO75390 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSO75390 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSO75390 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSO75390 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSO75390 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSO75390 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSO75390 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSO75390 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSO75390 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSO75390 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSO75390 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSO75390 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSO75390 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSO75390 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSO75390 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSO75390 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSO75390 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSO75390 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSO75390 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSO75390 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSO75390 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSO75390 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSO75390 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSO75390 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSO75390 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSO75390 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSO75390 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSO75390 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSO75390 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSO75390 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSO75390 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSO75390 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSO75390 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSO75390 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSO75390 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSO75390 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSO75390 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSO75390 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSO75390 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSO75390 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSO75390 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSO75390 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSO75390 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSO75390 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSO75390 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSO75390 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSO75390 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSO75390 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSO75390 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSO75390 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSO75390 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSO75390 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSO75390 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSO75390 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSO75390 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSO75390 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSO75390 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSO75390 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSO75390 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSO75390 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSO75390 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSO75390 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSO75390 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSO75390 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSO75390 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSO75390 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSO75390 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSO75390 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSO75390 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSO75390 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSO75390 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSO75390 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSO75390 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSO75390 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSO75390 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSO75390 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSO75390 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSO75390 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSO75390 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSO75390 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSO75390 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSO75390 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSO75390 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSO75390 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSO75390 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSO75390 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSO75390 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSO75390 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSO75390 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSO75390 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms