Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP4O75096 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP4O75096 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP4O75096 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP4O75096 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP4O75096 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP4O75096 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP4O75096 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP4O75096 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP4O75096 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP4O75096 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP4O75096 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP4O75096 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP4O75096 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP4O75096 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP4O75096 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP4O75096 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP4O75096 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP4O75096 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP4O75096 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP4O75096 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP4O75096 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP4O75096 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP4O75096 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP4O75096 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP4O75096 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP4O75096 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP4O75096 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP4O75096 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP4O75096 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP4O75096 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP4O75096 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRP4O75096 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP4O75096 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP4O75096 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP4O75096 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP4O75096 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP4O75096 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP4O75096 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP4O75096 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP4O75096 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP4O75096 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP4O75096 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP4O75096 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP4O75096 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP4O75096 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP4O75096 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP4O75096 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP4O75096 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP4O75096 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP4O75096 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP4O75096 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP4O75096 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP4O75096 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP4O75096 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP4O75096 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP4O75096 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP4O75096 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP4O75096 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP4O75096 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP4O75096 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP4O75096 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP4O75096 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP4O75096 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP4O75096 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP4O75096 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LRP4O75096 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP4O75096 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP4O75096 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP4O75096 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP4O75096 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP4O75096 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP4O75096 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms