Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra6O70491 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra6O70491 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra6O70491 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra6O70491 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra6O70491 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra6O70491 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra6O70491 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stra6O70491 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms