Protein–RNA interactions for Protein: O70361

Per3, Period circadian protein homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per3O70361 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Per3O70361 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Per3O70361 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Per3O70361 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Per3O70361 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Per3O70361 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Per3O70361 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Per3O70361 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Per3O70361 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Per3O70361 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Per3O70361 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per3O70361 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per3O70361 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per3O70361 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per3O70361 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Per3O70361 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per3O70361 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per3O70361 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per3O70361 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per3O70361 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per3O70361 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per3O70361 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per3O70361 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per3O70361 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per3O70361 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per3O70361 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per3O70361 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per3O70361 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Per3O70361 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Per3O70361 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Per3O70361 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Per3O70361 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per3O70361 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per3O70361 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per3O70361 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per3O70361 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per3O70361 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per3O70361 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per3O70361 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per3O70361 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per3O70361 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per3O70361 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Per3O70361 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per3O70361 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per3O70361 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per3O70361 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per3O70361 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per3O70361 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per3O70361 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per3O70361 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per3O70361 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per3O70361 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per3O70361 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per3O70361 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per3O70361 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per3O70361 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per3O70361 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per3O70361 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per3O70361 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per3O70361 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per3O70361 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per3O70361 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per3O70361 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per3O70361 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per3O70361 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Per3O70361 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Per3O70361 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Per3O70361 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per3O70361 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per3O70361 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per3O70361 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per3O70361 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per3O70361 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per3O70361 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per3O70361 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per3O70361 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per3O70361 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per3O70361 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per3O70361 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per3O70361 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Per3O70361 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Per3O70361 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per3O70361 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per3O70361 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per3O70361 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per3O70361 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per3O70361 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per3O70361 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per3O70361 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per3O70361 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per3O70361 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per3O70361 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per3O70361 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per3O70361 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per3O70361 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Per3O70361 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Per3O70361 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Per3O70361 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Per3O70361 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Per3O70361 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms