Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF4O60810 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF4O60810 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms