Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX2O60749 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX2O60749 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX2O60749 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX2O60749 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX2O60749 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX2O60749 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX2O60749 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX2O60749 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX2O60749 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX2O60749 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX2O60749 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX2O60749 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX2O60749 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX2O60749 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX2O60749 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX2O60749 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX2O60749 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX2O60749 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX2O60749 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX2O60749 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX2O60749 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX2O60749 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX2O60749 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX2O60749 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX2O60749 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX2O60749 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX2O60749 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX2O60749 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX2O60749 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX2O60749 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX2O60749 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX2O60749 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX2O60749 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX2O60749 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX2O60749 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX2O60749 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX2O60749 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX2O60749 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX2O60749 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX2O60749 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX2O60749 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX2O60749 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX2O60749 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX2O60749 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX2O60749 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX2O60749 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX2O60749 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX2O60749 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX2O60749 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX2O60749 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX2O60749 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX2O60749 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX2O60749 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX2O60749 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX2O60749 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX2O60749 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX2O60749 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX2O60749 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX2O60749 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX2O60749 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX2O60749 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX2O60749 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX2O60749 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX2O60749 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX2O60749 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX2O60749 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX2O60749 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX2O60749 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX2O60749 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX2O60749 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX2O60749 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX2O60749 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX2O60749 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX2O60749 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX2O60749 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX2O60749 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX2O60749 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX2O60749 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX2O60749 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX2O60749 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX2O60749 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX2O60749 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX2O60749 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX2O60749 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX2O60749 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX2O60749 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX2O60749 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms