Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN2O60636 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN2O60636 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms